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Integrarea se produce adesea la nivelul genei E2 care este astfel inactivata; ca urmare a acestui proces rezulta o expresie necontrolata a genelor E6 si E7. Oncoproteinele E6 si E7 perturba ciclul celular prin legarea si inactivarea a doua human papillomavirus positive ale gazdei cu rol important in reglarea diviziunii celulare normale: proteina supresoare tumorala p53 si proteina retinoblastomului pRb.

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